Tra le varie specie di bonsai, ci sono alcune come ad esempio l'olmo e l'acero che vanno potati nel periodo che va dalla primavera all'autunno, mentre altri di origine tropicale come ad esempio i ficus, si possono potare in qualsiasi periodo dell'anno. Questa specie infatti è provvista di un apparato radicale di tipo sospeso che si sviluppa dai rami, e scende in modo parallelo rispetto al tronco principale. La potatura in questo caso, va fatta soprattutto per un fattore estetico, in quanto vederle ad occhio nudo deturpa la bellezza della pianta, sia dal punto di vista dei fiori che del fogliame. Dopo ogni intervento di potatura delle radici, essendo concreto il pericolo di infezioni, bisogna somministrare al bonsai per almeno un mese, dei fertilizzanti naturali a base di erbe, misti all'acqua delle innaffiature.